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新的检测方法改进了马扼杀疾病的诊断检测

发布时间:2022-10-08 08:52:46编辑:愉快的缘分来源:

德克萨斯A&M大学马传染病实验室EIDL发起的研究勒索的基因组成分现已导致德克萨斯A&M兽医医学诊断实验室TVMDL的检测得到改进。

勒死病是一种高度传染性疾病,会影响马的上呼吸道系统和淋巴结。该病是由细菌马链球菌属马亚种,马链球菌引起的。尽管可能存在临床症状,但诊断检测是识别勒死的唯一确定方法。

S.equi的祖先,Streptococcusequisubspecieszooepidemicus,S.zoo,被认为是一种共生生物,可能导致马的肺炎、子宫内膜异位症和流产。这两种生物一起导致马的高发病率和可变死亡率。

EllenRuthAlexanderMorris博士于2020年初开始从事该项目,担任研究生研究助理NoahCohen,VMD,博士,EIDL主任,位于大型动物临床科学系在兽医医学和生物医学科学学院。

“最初没有开发新检测方法的计划,”亚历山大·莫里斯说。“这个想法来自另一个正在进行的项目,我们正在使用全基因组测序检查50株马链球菌和50株S.zoo之间的全基因组差异。”

他们对不同菌株的评估导致开发了额外的引物,这些引物是可用于检测马链球菌和动物园链球菌的DNA序列。

目前的检测方法

经典地,通过以缓慢且不太敏感的方法培养S.equi和S.zoo来检测扼杀。随着时间的推移,已经开发出使用聚合酶链式反应、PCR技术的多项测试来分别检测马链球菌和动物园链球菌。

虽然比细菌培养更快、更敏感,但对勒死的PCR检测仍然有些限制。PCR测试使用引物靶向特定的DNA序列来确定生物体的存在。由于S.equi和S.zoo之间的遗传相似性,一些测试可能无法区分这两种生物,并可能导致假阳性。

相反,在一些样本中,马链球菌的典型目标序列已被截断或删除,因此测试会导致假阴性。其他PCR测试,例如之前在TVMDL提供的测试,由于生物体的多种遗传相似性,无法区分与S.equi和S.zoo的共感染。

改进的PCR测试

新的引物是从德克萨斯马的临床样本中收集的S.equi和S.zoo菌株设计的,并使用来自世界各地的公开可用的S.equi和S.zoo菌株。TVMDL的分子诊断部门使用新引物进行了验证测试,并确定它们可用于检测和区分马链球菌和动物园链球菌。该测定还包括一个内部对照,用作PCR效率和样品抑制的监测器。验证后,TVMDL现在可以使用这些引物进行常规诊断测试。

“我们希望这些新的PCR靶标将有助于诊断扼杀,识别同时感染马链球菌和动物园链球菌的病例,或改善这两种生物体之间的差异,”现在是博士后研究助理的亚历山大·莫里斯说在TVMDL。