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2024-08-02
A*STAR的新加坡基因组研究所(GIS)和SingHealthDuke-NUS生物多样性医学研究所(BD-MED)之间的合作已经破译了新加坡国花PapilionantheMissJoaquim,也就是俗称的VandaMissJoaquim的整个基因蓝图。VMJ)。通过基因组分析,化学分析进一步揭示了黄酮醇和花青素等天然产物,它们以其抗氧化特性和独特的颜色图案而著称。该研究于2022年9月15日发表在CommunicationsBiology上。
VMJ于1981年被宣布为新加坡的国花,从此吸引了当地人和游客。GIS和BD-MED团队首次采用多种基因测序技术组装了整个VMJ基因组,共揭示了19条染色体,跨越24亿个核酸碱基对,约32,000个基因。这些基因会影响影响兰花性状和细胞过程的蛋白质的产生,并证明我们的国花中存在天然产物,这导致其独特的色素沉着、气味和其他天然生物活性化合物。
对VMJ基因组的了解使团队能够进行化学分析,以揭示VMJ的抗氧化特性和独特的颜色模式——黄酮醇和花青素。还发现兰花含有凡达皂苷,这是一种能够减缓皮肤老化过程的生物活性化合物,之前在VMJ的种子亲本PapilionantheTeres中发现了这种化合物。
SingHealthDuke-NUSBD-MED主任、A*STARGIS生物多样性基因组学实验室高级组长TehBinTean教授说:“我们很高兴能够构建和破译我们的基因蓝图。国花,并希望这一成果对我们的民族遗产做出重大贡献。VMJ是一种开花壮观的兰花杂交种,被广泛用作400多种兰花杂交种的繁殖茎。
“关于其基因组构成的发现可以帮助我们更好地了解如何增强基因组资源,并为基因和代谢物工程的未来研究铺平道路。破译VMJ等植物物种的遗传密码也使我们能够发现天然存在的生物活性化合物,它可以用于医疗保健目的以及了解、预防和对抗疾病。”
GIS执行董事PatrickTan教授说:“新加坡的生物多样性很好,有超过4,000种本土植物在全球气候异常和问题面前受到威胁。得益于先进的测序技术,我们能够保护“通过测序保存遗传密码来研究植物群的基因组。我们非常荣幸能够以我们的国花开始研究新加坡植物生物多样性的旅程。
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