释放单细胞藻类生物技术潜力的测序项目

今天启动了一项雄心勃勃的计划，即在未来十年内对所有已知的类眼虫物种进行基因组测序。该倡议背后的科学家网络认为，它有可能推动从新生物燃料和可持续食品到抗癌药物等领域的突破。

眼虫国际网络(EIN)成立于2020年，是一个由全球数百名科学家组成的全球联盟，其共同目标是通过学术界和工业界之间的协作和综合组学来支持眼虫科学。曼彻斯特生物技术研究所所长RobField教授是EIN的指导委员会成员，他和他的实验室将成为跨学科科学家网络的一部分，致力于了解和发现800多种物种的能力，眼虫的菌株。

EIN今天在BiologyOpen上发表了一份立场文件，概述了为近1,000种已知的类眼虫物种共同努力生成高质量参考基因组的案例。

类眼虫是原生生物群的一部分，是不属于动物、植物或真菌群的真核生物的家园。这些多样化的单细胞生物存在于世界各地极其广泛的生态系统中。

多种类眼虫物种具有转化应用，在生物燃料、营养保健品、生物修复、癌症治疗甚至机器人设计模拟器的生产中显示出巨大的前景。由于缺乏高质量的参考基因组，它们的巨大潜力在很大程度上尚未开发。

类眼虫基因组提出了一个特殊的测序挑战，因为它们是次级内共生的一个例子——容纳线粒体、叶绿体和它们包裹的生物体的遗传物质残余物以获得这些细胞器。

因此，通过基因组学在任何水平上探索了不到20个物种的转化潜力。EIN认为是时候解决这个问题了。

通过为已知的类眼虫物种生成高质量的参考基因组，EIN将致力于：

了解类眼虫的基本生物学知识;

了解类眼虫的进化;

最大限度地利用眼虫在生态和环境管理中的应用;

探索、翻译和商业化眼虫产品。

EIN收集的数据将通过欧洲核苷酸档案馆(ENA)公开提供给科学界。一旦进入ENA，注释的基因组就可以导入到EnsemblProtists等资源中，并以统一和公平的方式呈现给研究社区。

菲尔德教授对这一领域的兴趣可以追溯到2015年，当时他和他的实验室率先描述了纤细裸藻的意想不到的能力，包括用它来制造一系列糖和其他天然产品。从那以后，他们继续描述了Euglena生产的新型环肽抗真菌剂，这可能被证明对制药工业有用。他们希望与该网络的其他成员一起合作，更好地了解800多种眼虫并开发它们的潜力。

EIN的创始主席兼英国欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)的生物信息学家ThankGodEchezonaEbenezer博士说：“Euglena国际网络将在帮助聚集类眼虫专家以增加我们对类眼虫的理解方面发挥关键作用。类眼虫生物学及其转化应用。这可能有助于加深我们对寄生性进化、社交游戏、开发喷气燃料或支持人类太空探索的理解。”