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2024-08-02
澳大利亚麦格理大学的一组研究人员发现了一些证据,表明一些古生菌具有整合子。在他们发表在《科学进展》杂志上的论文中,该小组描述了他们如何使用最近开发的一种称为宏基因组组装基因组(MAG)的技术以新的方式研究古细菌样本的基因组,以及他们通过这样做学到了什么。
地球上的生命分为三个域,真核生物、细菌和古细菌。第三个领域,古细菌,类似于细菌——它的成员通常被称为古细菌。与细菌一样,古细菌是单细胞的,但与细菌不同的是,它们依赖于细胞膜中的脂质。
在这项新的努力中,研究人员正在研究细菌和古细菌交换基因的方式,并想知道它们是否有可能具有整合子——细菌中的基因捕获和传播系统,使用基因盒传递所涉及的蛋白质。为了找到答案,他们求助于MAG——一种允许搜索称为AttC的单基因和基因重组位点的技术,该位点用于编码蛋白质整合子整合酶(IntI)。
使用这项技术,他们找到了许多匹配项。在扫描的6,700个基因组中,他们发现了75个匹配项,跨越9个门,每个都是一个整合子的证据。结果证明它们都具有与细菌中发现的整合子相同的结构,这表明使用了盒。
研究人员认为,这表明他们发现的古细菌应该能够与细菌交换基因,反之亦然,就像细菌之间交换基因一样容易。为了证明他们的想法是正确的,他们从古细菌标本中合成了AttC,并将其暴露于大肠杆菌标本中。测试表明,已经创建了允许基因交换发生的盒式磁带。
在古细菌中寻找整合子肯定会开辟新的研究途径。一种方法是研究将基因从古细菌交换到细菌的可能性,以帮助后者对旨在杀死它们的药物产生抗药性。研究人员还指出,如果提供完整的古细菌基因组,将会很有帮助。
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