3D模型在原子尺度上揭示了FoxH1如何与基因组中的特定点结合

转录因子是与DNA相互作用以调节某些基因功能的蛋白质。通常，单个转录因子与基因组中的多个区域结合，因为它协调复杂的细胞反应，这需要激活或抑制多个基因。FoxH1是胚胎发育过程中必不可少的转录因子，在成人中，它与肺癌和某些类型白血病的进展有关。

由ICREA研究员MariaJ.Macias博士领导的巴塞罗那IRB科学家们在原子尺度上详细描述了FoxH1因子与DNA结合的机制。换句话说，他们已经描述并开发了3D模型，这些模型重现了FoxH1如何与基因组中的特定点结合以执行其功能。

“FoxH1引起了我们实验室和其他实验室的兴趣，因为它在胚胎发育和一些肿瘤的发展中起着非常重要的作用。虽然它的相关性早已为人所知，但一直无法描述它直到现在才与DNA结合，”巴塞罗那IRB大分子组装实验室结构表征负责人Macías博士解释道。

“我们在这项工作中发现的结构细节可能允许开发与FoxH1相互作用的特定分子，并且在未来可能会产生治疗这种蛋白质起关键作用的疾病的药物，”她补充道。

不寻常的绑定机制

FoxH1属于一个非常大的转录因子家族，称为FOX，但它有一些特殊性。最受研究人员关注的特性是能够与DNA结合，即使它被称为核小体的结构压缩和保护。

为了与DNA结合并发挥其调节功能，大多数转录因子需要该分子解旋，从而暴露自身。与FoxH1一样，与压缩DNA结合的转录因子被称为先驱因子。

“此外，FoxH1结合的DNA序列不同于其家族中其他转录因子识别的序列，因此我们想了解允许FoxH1获得这些非常特殊的特性的结构特征，”EricAragon博士说。

“我们很高兴能够在1Å分辨率以下解析这些结构，因为它使我们能够非常详细地描述相互作用，”来自同一实验室的博士后研究员RadoslawPluta博士总结道。博士。Aragón和Pluta是该研究的共同第一作者。

实验室未来的工作将侧重于描述FoxH1与核小体在原子尺度上的相互作用。