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2024-08-02
来自国家医学图书馆(NLM)和合作学术研究机构的一组研究人员开发了一个计算管道,用于识别和更好地理解类病毒和类病毒共价闭合环状RNA(cccRNA,也简称为环状RNA)。这是一种单链RNA,与线性RNA不同,它形成共价闭合的连续环。研究结果发表在《细胞》杂志上。
类病毒是只有250到400个核苷酸的环状RNA,是已知感染因子中最小和最简单的。人们认为它们只会在植物中引起感染。人们对类病毒和类病毒RNA的多样性知之甚少,这促使研究人员更多地研究这些亚病毒因子及其在其他环境和宿主中的可能丰度。
通过在5,131个元转录组和1,344个植物转录组中搜索类病毒cccRNA,研究人员发现了11,378个类病毒cccRNA,跨越4,409个物种级簇。与先前确定的类病毒样元素相比,这一发现增加了五倍。
在这个多样化的集合中,研究人员发现,这种独特的病原体类别并不像以前认为的那样仅限于传播到少数植物,而是在各种环境和宿主中都很常见且大量存在,可与更广为人知的RNA病毒相媲美。此外,还发现了人类丁型肝炎病毒(丁型肝炎病毒)的远亲,揭示了这种重要人类病原体的起源以及全新的病毒类型。
“这项工作为全世界的研究人员开辟了新的方向,”该研究的合著者兼NLM校内研究计划计算生物学分部的高级研究员EugeneV.Koonin博士说。“我们目前正在进行一些后续分析,”他补充说。
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