多个突变可能有助于omicron变体逃逸抗体

根据今天发表在eLife上的一项研究，一系列不同的突变或突变组合可能有助于SARS-CoV-2的omicron变体逃避免疫反应或治疗性抗体。

这项研究可能有助于科学家了解SARS-CoV-2病毒是如何进化的。它还可以帮助他们预测新突变如何影响病毒逃避先前免疫力的能力，或者哪些疗法可能对新出现的变体有效。

SARS-CoV-2的omicronBA.1变体能够重新感染以前感染过早期病毒株的人。omicron菌株中的突变影响刺突蛋白，使病毒能够结合并感染细胞，这使得免疫系统抗体更难为响应早期菌株而产生，以识别刺突蛋白并中和病毒。

“大多数研究都集中在单一突变如何让SARS-CoV-2变体逃避预先存在的抗体，”共同主要作者、马萨诸塞州剑桥市哈佛大学生物与进化生物学系研究生AliefMoulana说。.“但我们想了解多个突变之间的相互作用如何影响病毒躲避抗体或感染细胞的能力。”

Moulana与哈佛同事、博士后ThomasDupic是该研究的同等贡献者和共同主要作者;和研究生JeffreyChang;和前哈佛大学同事安吉拉菲利普斯，她现在是加州大学旧金山分校微生物学和免疫学系的助理教授。

该团队之前已经创建了一个库，其中包含SARS-CoV-2原始毒株和omicron之间刺突蛋白的抗体结合部分的所有可能构型。在这个区域，omicronBA.1与原始菌株有15个氨基酸替换不同。在当前的研究中，他们创建了一个包含32,768个变体的库，其中包含这15种突变的所有可能组合。然后，他们对酵母进行基因工程改造，使其表达与每种基因组合的结合区域，并系统地测试了它们如何与用于治疗COVID-19的四种单克隆抗体相互作用。

他们发现，只要一两个突变对刺突蛋白的结合区域产生显着影响，就可以让它躲避多种抗体。许多影响不太明显的突变的组合也可以使病毒逃避特定抗体。

但他们也发现了重要的权衡。例如，一些允许病毒躲避一种抗体的突变可能使其对另一种抗体敏感。使抗体逃逸的突变也可以显着削弱刺突蛋白结合和感染细胞的能力。然而，其他突变可以帮助弥补失去的结合和感染能力。

“我们展示了omicronBA.1变体如何进化以躲避抗体，同时保持其感染细胞的能力，”Dupic说。“我们的工作表明，这种进化是由免疫逃逸和补偿性突变的需要驱动的，补偿性突变弥补了逃逸突变对变体结合宿主细胞能力的负面影响。”

作者说，需要更多的研究来证实在他们的实验室实验中观察到的相互作用与现实世界的感染有关。但与此同时，他们的方法可能会揭示有关SARS-CoV-2进化的更多见解。

“我们的技术可以让我们研究新SARS-CoV-2毒株的突变如何帮助逃避免疫系统，”资深作者、哈佛大学生物与进化生物学教授MichaelDesai解释说。“它还可以帮助我们了解病毒的突变如何让它感染不同的物种。”