古代DNA分析揭示了南美洲的早期人类

美洲是最后一个有人类居住的大陆。越来越多的考古和基因组证据暗示了一个复杂的定居过程。对于南美洲来说尤其如此，那里出乎意料的祖先信号已经为早期迁移到该大陆不同地区提出了令人困惑的情景。

许多悬而未决的问题仍然存在，例如第一批人类是沿着太平洋沿岸还是通过其他路线向南迁移的。虽然有考古证据表明古代土著人民在美洲最初的人类迁徙期间从北向南迁移，但这些古代人类到达后去往何处仍然难以捉摸。

佛罗里达大西洋大学的研究人员与埃默里大学合作，利用在巴西东北部两个不同考古遗址(PedradoTubarão和Alcobaça)出土的两个古人类个体的DNA以及强大的算法和基因组分析，揭开了南美洲深厚的人口历史区域层面的一些意想不到和令人惊讶的结果。

研究人员不仅提供了新的遗传证据来支持从北向南向南美洲迁移的现有考古数据，而且他们还首次发现了沿大西洋沿岸的相反方向的迁移。这项工作为复杂的古代中南美洲迁徙路线提供了迄今为止最完整的遗传证据。

在主要发现中，研究人员还在南美洲古代个体的基因组中发现了尼安德特人血统的证据。尼安德特人是在旧石器时代晚期和中期分布于欧亚大陆的已灭绝的古人类种群。

发表在《英国皇家学会学报B：生物科学》杂志上的研究结果表明，靠近大西洋沿岸的人类运动最终将古乌拉圭和巴拿马连接在一条南北迁移路线上——5,277公里(3,270英里)分开。根据古代个体的年龄，这种新颖的迁移模式估计发生在大约1000年前。

研究结果表明，来自巴西东北部、圣拉戈亚(巴西东南部)、乌拉圭和巴拿马的古代基因组之间存在明显的关系。这个新模型表明，大西洋沿岸的定居仅发生在太平洋沿岸和安第斯山脉大部分地区的人口稠密之后。

“我们的研究为南美洲大西洋沿岸区域范围内的古代迁徙事件提供了关键的基因组证据，”MichaelDeGiorgio博士说，他是专门研究人类、进化和计算基因组学的共同通讯作者，也是副教授在FAU工程和计算机科学学院的电气工程和计算机科学系。“这些区域性事件可能源于涉及太平洋沿岸附近南美洲最初土著人民的迁徙浪潮。”

研究人员还在巴拿马的一个古老基因组中发现了强烈的澳大利亚(澳大利亚和巴布亚新几内亚)遗传信号。

“大洋洲和美洲之间有一整个太平洋，我们仍然不知道这些祖先的基因组信号是如何出现在中美洲和南美洲而不在北美留下痕迹的，”AndreLuizCampelodosSantos博士说。，第一作者，考古学家，FAU电气工程与计算机科学系博士后。

为了进一步增加现有的复杂性，研究人员还在古代乌拉圭和巴拿马人中发现了比尼安德特人血统更大的丹尼索瓦人。丹尼索瓦人是一群已灭绝的人类，最初是从2008年左右发现的指骨尖端的DNA序列中发现的。

“丹尼索瓦人的血统一路传到南美洲，这真是了不起，”这篇文章的共同通讯作者、专门研究古代DNA分析的约翰林多博士说，他是人类学系的助理教授。埃默里大学。“这种混合物一定是在很久以前发生的，也许是40,000年前。丹尼索瓦人的血统持续存在，它的遗传信号使它成为一个只有1,500年历史的乌拉圭古代个体，这表明这是一次大的混合事件。一群人类和丹尼索瓦人。”

此前在巴西累西腓的伯南布哥联邦大学，多斯桑托斯及其同事发现了来自巴西东北部的两个古人类的遗骸，这些遗骸可以追溯到至少1000年前，并将他们送到林多进行DNA提取和随后的基因组研究。测序和分析。然后将原始数据发送到FAU，对来自巴西东北部的全基因组序列进行计算分析。

研究人员将来自巴西东北部的两个新测序的古代全基因组与当今世界范围内的基因组和来自美洲的其他古代全基因组进行了比较。林多说，截至文章发表之日，只有十几个来自南美洲的古代全基因组被测序和发表，而欧洲则有数百个。

除了在巴西东北部、乌拉圭、巴西东南部和巴拿马产生样本的地点发生大规模墓葬外，考古记录中没有其他证据表明它们之间有共同的文化特征。重要的是，来自巴西东南部的被分析的古代个体比来自巴西东北部、乌拉圭和巴拿马的古代个体大约9000年，这足以让人们有足够的时间来实现预期和明显的文化差异。此外，巴西东北部、乌拉圭和巴拿马虽然年龄相近，但相距数千公里。

“这项开创性的研究涉及许多不同的领域，从考古学到生物科学再到基因组学和数据科学，”FAU工程与计算机科学学院院长StellaBatalama博士说。“我们佛罗里达大西洋大学的科学家与埃默里大学合作，帮助阐明了美洲难题的一个重要部分，如果没有强大的基因组和计算工具和分析，就无法解决这个难题。”

研究合著者是埃默里大学的AmandaOwings博士;HenrySocratesLavalleSullasi，博士，巴西伯南布哥联邦大学;和纽约州立大学布法罗分校的OmerGokcumen博士。