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2024-08-02
细胞外信号调节激酶(ERK)通过催化多种底物的磷酸化,在多种细胞信号传导过程中发挥重要作用。该酶本身在两个不同位点被另一种称为丝裂原活化蛋白激酶激酶(MEK)的酶磷酸化激活。
MEK/ERK通路参与细胞分裂、分化和死亡等过程,影响MEK/ERK通路的突变与包括癌症在内的一系列疾病有关。因此,了解MEK/ERK通路中涉及的机制和动力学对其作为治疗靶点的开发至关重要。
来自LudwigOxfordBranch的Byrne实验室的LewisMarsh与数学研究所和约克大学的同事一起,对Yeung等人最近发表的系统生物学模型进行了数学分析。他们之前对该模型的分析依赖于Byrne实验室使用计算代数和几何进行数学询问和确认的假设。
在他们的研究中,现在发表在《数学生物学通报》上,Marsh及其同事使用拓扑数据分析分析了ERK双磷酸化模型与野生型和病理相关MEK突变体数据集的动力学。以Yeung等人的工作为基础。等,这项研究展示了代数、几何和拓扑分析方法如何不仅可以告知和超越此类模型的动力学和统计分析,而且可以指导未来的实验设计和研究方向。
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