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2024-08-02
鲨鱼占据着不同的生态位,在海洋生态系统中发挥着关键作用,通常是顶级掠食者。它们被认为是进化缓慢的谱系,并且被认为具有极低的癌症发病率。这两个特征可以用低核突变率来解释。为了估计核突变率,海洋生物学家团队生成了肩章鲨(Hemiscyllium ocellatum)的高质量参考基因组;他们还对肩章鲨父母和九个后代的整个基因组进行了重新测序,以检测新的突变。
鲨鱼是最早的脊椎动物进化枝之一的成员,这些脊椎动物进化枝是在二叠纪和侏罗纪时期的大规模灭绝事件中出现的,辐射并主导了许多海洋食物网。
现代鲨鱼在调节和维护多种海洋生态系统中发挥着重要的功能作用。
然而,人们对鲨鱼种群的进化速度和适应潜力知之甚少,随着过度捕捞和栖息地丧失的双重生态压力的出现,这一事实变得更加引人注目。
在这项新研究中,维尔茨堡朱利叶斯·马克西米利安大学的曼弗雷德·沙特尔教授和他的同事们重点关注肩章鲨,这是一种小型卵生物种,栖息在澳大利亚东北部海域的珊瑚礁环境中。
首先,他们能够创建高质量的参考基因组,并对父母的整个基因组进行测序,然后对九个后代进行测序,以发现后代中发生的新突变。
我们估计每代每个碱基对的突变率为 7*10 -10 - 比哺乳动物低 10 到 20 倍。
这代表了任何脊椎动物进化枝的最低直接估计突变率之一。
“长期以来,人们一直认为鲨鱼的癌症发病率极低,”沙特尔教授说。
“低突变率可能在这方面发挥决定性作用。”
“最初听起来对动物来说是个好消息,然而,也带来了一些问题。”
“突变至关重要,因为它们增加了种群内的遗传变异性,从而能够适应新的条件和进化变化。”
“由于鲨鱼进化非常缓慢,它们面临着无法承受过度捕捞和栖息地丧失等生态压力的风险。”
这篇论文发表在本月的《自然通讯》杂志上。
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