潜在的早期食管癌抗原DDX53

2023 年 11 月 10 日， 《Oncoscience》(第 10 卷)发表了一篇新的研究论文，题为“癌症睾丸抗原 DDX53 作为潜在早期食管癌抗原的免疫信息学评估”。

T 淋巴细胞与促进促炎、促肿瘤微环境有关，从而使食管癌 (ESCA) 的预后恶化。在他们的新研究中，来自南佛罗里达大学、俄勒冈健康与科学大学医院和H. Lee Moffitt 癌症中心和研究所确定了肿瘤驻留 T 细胞受体 (TCR) 互补决定区 3 (CDR3) 氨基酸序列，并采用了特别适合大数据设置的算法来评估 TCR CDR3-癌症睾丸抗原(CTA)化学互补性。

“为了更好地了解 T 细胞对 ESCA 的潜在积极和消极影响，我们从 TCGA-ESCA 全外显子序列 (WXS) 文件中恢复了 TCR 重组读数，获得了 TCR CDR3 AA 序列，并评估了这些序列的化学互补性与 CTA 一起使用，因为几十年来，这些抗原已被许多方法表征为候选癌症抗原。”

ESCA TCR CDR3 和癌睾丸抗原 DDX53 的化学互补性代表了无病生存 (DFS) 的区别，其中第 50 个百分位上方的互补性组与较差的 DFS 相关。高 TCR CDR3-DDX53 互补性组也代表了更大比例的缺乏 DDX53 表达的肿瘤样本。这些数据和分析提出了一个问题：TCR CDR3-DDX53 化学互补性评估是否检测到选择 DDX53 阴性细胞的 ESCA 免疫反应。

“总的来说，这些数据与 TCR-抗原相互作用诱导选择性压力导致抗原丢失的可能性一致，这一过程被称为免疫编辑 [16-18 ] ，并最终导致肿瘤细胞逃离抗肿瘤药物。免疫反应。ESCA 的这些数据也与卵巢癌环境中高 CS、低生存率获得的类似数据一致 [ 19 ]。”