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2024-08-02
中国的研究人员绘制了Chiridota heheva的整个基因组图谱,这是一种在潜艇前往热液喷口时在 2,428 m 深处采集到的海参。
海参属于棘皮动物,因此与海胆和海星有亲缘关系,海星是一群具有极不寻常身体结构的动物。
它们在世界各地的海底都有发现,它们吞食碎屑并用触手探索沉积物。
虽然可以获得其他高质量的海参基因组,但这项新工作提供了第一个在热液喷口收集的海参样本——Chiridota heheva的基因组。
Chiridota heheva于 2004 年首次被描述,分布于西大西洋较深处的地区,但分布广泛。
它是少数占据所有三种化学合成生态系统的棘皮动物之一:热液喷口、冷泉和有机瀑布。这表明该物种很好地适应了深海还原环境。
与大多数冷泉和热液喷口栖息的物种不同,Chiridota heheva不含有化学合成细菌。
它从多种来源获取养分,从沉积物碎屑、悬浮物质和木材碎片(如果有)中提取有机成分。
“在热液喷口发现的生物是地球上最独特的生命形式之一,因为它们进化出了特殊的适应能力,可以在这些恶劣的条件下生存和繁殖,”主要作者、三亚深海科学与工程研究所的蒲玉金博士说和她的同事。
“例如,许多微生物利用特殊的代谢功能来处理丰富的硫和铁,并承受通风口附近的巨大热量。”
“除了微生物之外,甚至还有适应热液喷口条件的多细胞和高级生物,包括各种蠕虫、蜗牛、螃蟹和虾。”
在他们的研究中,作者对从印度洋底部Kairei 喷口区(深度 2,428 m)收集的Chiridota heheva个体的基因组进行了测序。
他们说:“凯雷喷口周围的水溶解铁含量特别丰富,加剧了高静水压、黑暗和温度波动的恶劣条件。”
“初步的比较基因组分析表明,该海参中的几个基因家族得到了扩展,这意味着该物种比相关物种具有更多的特定基因组。”
“这些扩展且独特的基因参与 DNA 修复和铁代谢等过程——这是对恶劣、富含铁环境的适应反映在该物种基因组中的第一个迹象。”
“基因组数据将为海参和独特的喷口动物群的进一步研究提供宝贵的资源。”
研究结果发表在《GigaScience》杂志上。
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