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2024-08-02
来自 HudsonAlpha 生物技术研究所和其他地方的研究人员已经为d'Anjou 梨(欧洲梨(Pyrus communis)的一种短颈品种)生成了染色体规模的基因组组装。
欧洲梨属于梨属,蔷薇科梨属,包括栽培梨和野生梨。
该属分为两大类:欧洲梨和亚洲梨,它们的分歧估计大约在 3-6 百万年前。
目前在西亚和东亚、欧洲、北非和中东至少发现了 26 个梨属物种和 10 个自然发生的种间杂交。
2021年,美国梨的利用产量价值达到3.53亿美元。这使得梨成为世界上种植最多的仁果类水果之一。
安茹梨是北美最重要的梨品种之一,也称为 Beurre d'Anjou 或简称 Anjou,被认为起源于比利时,以法国安茹地区命名。
“梨是美国西北部太平洋地区的一项大产业,”哈德森阿尔法生物技术研究所研究员、资深作者亚历克斯·哈克斯博士及其同事说。
“但你知道传统的梨育种几个世纪以来基本上没有变化吗?”
“这个缓慢的过程既困难又昂贵,需要长期投入劳动力、材料和土地空间资源。”
“然而,传统的梨育种可能会从基因组学中得到一些帮助,这要归功于学生、科学家和梨产业之间通过一项名为“美国校园树基因组”(ACTG) 的倡议所促进的独特合作。”
“ACTG 利用标志性且具有经济价值的树木来弥合学生与尖端基因组学之间的差距。”
“学生们合作组装、分析树木基因组,并在著名期刊上发表,获得了宝贵的经验。”
ACTG 学生的细致工作实现了安茹梨的完全定相染色体规模组装——比以前的努力取得了重大进步。
组装揭示了数千个基因组变异,这对梨育种工作非常重要。
这种高质量的资源为梨育种者打开了信息宝库。
该组装也是研究梨进化、驯化和分子育种的重要工具。
Ines Hanrahan 博士表示:“ACTG 项目不仅为有价值的梨品种建立了高质量的基因组资源,最终使种植者和消费者受益,而且还为近 20 名学生和科学家提供了有关苹果和梨行业需求的教育。”华盛顿树果研究委员会执行主任。
该团队的论文发表在《G3:基因、基因组、遗传学》杂志上。
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