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琼脂糖凝胶电泳跑成这样是怎么回事? 琼脂糖凝胶电泳失败原因

发布时间:2023-07-15 12:03:40编辑:温柔的背包来源:

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一、琼脂糖凝胶电泳跑成这样是怎么回事?

二、琼脂糖凝胶电泳 NTC为什么出现条带,而且和实验孔在同一位置,求所有可能的解释

三、为啥我的DNA在琼脂糖凝胶电泳中跑不下来?

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一、琼脂糖凝胶电泳跑成这样是怎么回事?

琼脂糖凝胶具有网络结构,网络结构的密度取决于琼脂糖的浓度。核酸分子在琼脂糖凝胶中电泳时,具有电荷效应和分子筛效应,游动时受到抵抗。

琼脂糖凝胶的浓度需要根据你的目标条带的长度进行调整,通常在0.5%到2%之间。低浓度凝胶用于大片段核酸电泳,高浓度凝胶用于小片段核酸分析。所以琼脂糖的浓度影响核酸分子的“运行”速度。

在我们实验室,目标条带一般不超过1kb,我们使用1%凝胶。至于条带模糊、扩散,可能是由于以下原因: 1)电泳缓冲液多次使用后,离子浓度低,pH值升高,缓冲液性能下降,条带可能会消失。显得模糊且不规则迁移。

2) 样品量添加过多可能导致条带模糊,样品量添加过少可能导致条带弱甚至丢失。

3)电压和温度过高,可能会导致条带模糊或迁移。

4) 样品中盐含量和杂志蛋白过高会产生模糊和缺失的条带。

5)核酸染色剂的稳定性和用量。实验室常用的核酸染色剂是溴化乙锭(EB),染色效果好,但稳定性差,且有毒性。当凝胶温度为50~60时添加EB。附上之前实验的图片,由于Marker时间太长,Marker特别弱,而且条带有点模糊,换了新的buffer后好多了。刚姜,分子生物学研究犬,欢迎讨论指正~

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二、琼脂糖凝胶电泳 NTC为什么出现条带,而且和实验孔在同一位置,求所有可能的解释

您正在进行PCR 产物的电泳吗?令人遗憾的是,阴性对照的条带大多是二聚体扩增的非特异性条带。也就是说,你的PCR失败了。建议提高PCR退火温度,或者更换引物再试。同时带上阳性对照(成功扩增的模板和引物)。

不要执着于出来的条带,条带应该是模糊的,不是特别亮的,如果是,那就老老实实重做吧。

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三、为啥我的DNA在琼脂糖凝胶电泳中跑不下来?

从你的描述和图片来看,我们可以看出几个问题。 1.75V电压,300mA电流,这个电流是不是有点太大了?可能需要更换电泳液。 2.你提到基因组DNA,基因组DNA是多少bp? 1%凝胶一般对应约500bp-1000bp的靶基因。如果你的条带出来了一点,可能是目标基因太大,目标基因的大小必须在标记的范围内。 3. 胶水匹配得很好,但为什么你的左右两个标记运行速度不同?这是一个不同的标记吗?如果是一样的话,那我就收回那句话,胶水很好。 4. 我发现有些乐队非常分散。我认为可能是大电流、高热量造成的。最终,目标频段消失了。

以上就是关于琼脂糖凝胶电泳跑成这样是怎么回事?的知识,后面我们会继续为大家整理关于琼脂糖凝胶电泳失败原因的知识,希望能够帮助到大家!