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质粒dna的提取与基因组dna的提取在原理和方法方面有何异同? 质粒dna的提取

发布时间:2023-09-26 13:07:32编辑:温柔的背包来源:

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一、质粒dna的提取与基因组dna的提取在原理和方法方面有何异同?

二、质粒DNA的提取溶液1 23 的作用

一、质粒dna的提取与基因组dna的提取在原理和方法方面有何异同?

质粒DNA提取一般用沸水浴法和碱裂解法,现在一般用碱裂解法,试剂盒都有。主要是提取细胞内的环状质粒,一般需要SDS裂解,RNase降解,然后过柱洗脱。过程相对简单。

基因组DNA提取较为复杂,还需要SDS裂解和RND酶降解,但降解时间较长。同时,部分革兰氏阳性菌需要溶菌酶处理,最后用氯仿-苯酚去除蛋白质。这个步骤重复多次。用氯仿除去过量的苯酚后,用乙醇洗涤和干燥,并溶解在TE缓冲液中。整个过程比质粒提取更复杂,耗时更长。

二、质粒DNA的提取溶液1 23 的作用

为了让DNA更好的结合到硅酸盐纤维膜上。用碱裂解法制备质粒DNA时,溶液I、II、III中各成分的作用是1、溶液I:葡萄糖阻止悬浮的大肠杆菌在管底快速沉积;EDTA是Ca2、Mg2等二价金属离子的螯合剂,主要作用是螯合二价金属离子,从而抑制DNA酶的活性。可以加入RNA酶A来消化RNA。2、方案二:这一步是碱处理。

其中NaOH主要用于溶解细胞,释放DNA,因为在强碱性的情况下,细胞膜已经从双层膜结构变成了微胶囊结构。SDS与NaOH结合的目的是增强NaOH的强碱性,SDS作为阴离子表面活性剂破坏脂双层膜。这一步需要记住两点:第一,时间不能太长,因为在这样的碱性条件下,基因组DNA片段会慢慢断裂;第二,一定要轻轻搅拌,否则基因组DNA会断裂。

3、溶液III:溶液III用于蛋白质沉淀和中和反应。其中乙酸钾形成PDS是为了用钾离子取代SDS中的钠离子。因为十二烷基硫酸钠遇到钾离子就变成了十二烷基硫酸钾,PDS),而PDS不溶于水,同时一个SDS分子平均结合两个氨基酸,钾钠离子置换产生的大量沉淀自然沉淀了大部分蛋白质。2 M乙酸用于中和NaOH。

基因组DNA一旦断裂,只要是50-100 KB大小的片段,就没有办法被PDS共沉淀,所以碱处理时间要短,不允许剧烈振荡,否则最终得到的质粒中总会混入大量的基因组DNA,琼脂糖电泳可以观察到粗的总DNA条带。75%酒精主要用于净盐和抑制脱氧核糖核酸酶;同时,溶液III的强酸性也是为了让DNA更好的与硅酸盐纤维膜结合。

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